在"以人为本、整合培养、求是创新、追求卓越"的教育理念指导下，学校逐步完善以3M（多规格、多通道、模块化）和"宽、专、交"为特征的KAQ（知识、能力、素质）并重的人才培养模式，将112个本科专业分成若干学科大类，试行前期按大类培养，实施通识教育，后期进行宽口径专业教育的新模式，并着力构建研究型大学本科教育课程体系。新的课程结构图如下：
学校在总结实施学年学分制与新模式学分制经验基础上，从2002年起全面推进学分制教学管理，制定、修订了指导性教学计划和相关教务教学管理文件，开发了网络化现代教务管理系统，初步构建了以选课制为核心，弹性学制、主辅修制、重修制、导师制、绩点制等为辅助的教学管理模式，使学生在选择专业、课程、任课教师和学习进程等方面有了更多自主权，为推进自主性学习和培养交叉复合型人才创造了更为有利的条件。
学校从2004年秋季开始实行四学期制，每学年分秋、冬、春、夏四个学期。“四学期制”是在党的教育方针的指导下，学习国际先进经验、贯彻落实我校人才培养的理念和目标，全面推进教学、科研与内部管理体制改革的重要举措。通过“四学期制”的实施，促进以学分制为核心的教育教学改革，优化课程结构，转换教学范式，提高学生学习的效率和自主性，为教师教学与研究的有机结合创造条件，进一步拓宽国际合作交流渠道，建立适合研究型大学特点的新型教学和管理体系，提高学校的教育、科研、社会服务和国际交流水平。
